16岁女孩出现月经不规律和褐色分泌物的情况，这主要与青春期卵巢功能尚未发育完善有关。褐色分泌物可能是白带颜色异常或少量出血的表现，具体原因需要进一步检查确认。建议先明确是否有性生活史，同时需要做妇科检查来鉴别是否存在炎症或其他问题。由于年龄较小，内分泌系统仍在发育中，月经周期不稳定属于常见现象，但异常分泌物需引起重视，建议及时就医明确诊断。