扁桃体发炎一般不会影响抗原检测的结果。抗原检测是通过识别特定病原体的抗原成分来判断感染的，比如新冠病毒抗原检测就是针对新冠病毒的特异性抗原。扁桃体发炎通常由细菌或病毒感染引起，但这些病原体与抗原检测的目标抗原不同，不会干扰检测试剂对目标抗原的识别。只要正确采集样本，检测结果通常是可靠的。如果对结果有疑问，建议咨询专业医生。