上海市肺移植手术技术领先的医院包括上海肺科医院、复旦大学附属中山医院和上海交通大学医学院附属瑞金医院。这些医院拥有经验丰富的肺移植专家团队，如上海肺科医院的姜格宁教授、中山医院的王群教授等。关于费用问题，肺移植手术实际费用通常在30-50万元左右，包括手术费、器官获取费、免疫抑制剂和住院费用等。3000元可能是某项检查的单项费用，建议您到上述医院胸外科或移植科门诊详细咨询。